Problem No 1: Backup
'SD Card Copier' ist sicher ein Programm auf dem USB to SD Adapter, es kopiert jede einzelne Datei und fertigt somit kein Backup deiner SD Karte an.
Nimm wenn du Windows hast Win32Diskimager und speichere ein echtes Backup deiner SD Karte auf einen Rechner. Bei einer *.img werden auch nicht sichtbare Partitionen gesichert.
SD Karten, auch wenn da z.B. 8GB draufsteht, unterscheiden sich in der Anzahl Bytes. So kann es vorkommen das ein Image auf ein 8GB Karte geht oder es fehlen halt ein paar Byte. Aber dafür gibt es Programme.