Ich würde mich vorerst eher auf die 5 V Stromversorgung des Moduls konzentrieren.
Der I2C Bus selbst funktioniert ja, mit den im Pi eingebauten 3,3 V Pullups. Nur die CO2 Messung funktioniert nicht.
Wird in den /var/log/syslog* ein "undervoltage" angezeigt ?
Welches Netzteil und welchen Pi verwendest Du
und welche Stromverbraucher sind sonst noch aktiviert/angesteckt ?
Servus !