Zusätzlich zur Authentifizierung via Owncloud-Anwendung? Wenn Du jetzt nginx verwendest, dann etwa damit: http://wiki.nginx.org/NginxHttpAuthBasicModule
Ich empfände das aber als wenig sinnvoll und praktikabel. Wenn Du die verschiedenen owncloud-Applikationen verwenden willst, könnten ich mir gut vorstellen, dass diese dadurch ihre Funktionalität verlieren, da sie selbst nicht auf eine zusätzliche Authentifizierung ausgerichtet sind, aber ad hoc kann ich nichts detailliertes dazu sagen.